Taller de bioinformática: Visualización de datos de cáncer con Maftools
DESCRIPCIÓN
En este taller se verán los diferentes formatos de archivos que contienen datos de llamado de variantes y cual es la diferencia con los MAF y sus características, cómo convertir un VCF a un MAF y cómo se facilita la visualización de gráficos en cáncer.
El participante será capaz de identificar diferentes tipos de archivos provenientes de datos de análisis de llamado de variantes y generar gráficos con la paquetería Maftools.
- Duración de 3 horas incluyendo sesión de Q&A
- Ideal para personas que tienen conocimientos básicos de programación en R y quieren aprender a visualizar datos de cáncer.
- Incluye presentación, script y grabación vigente por 30 días.
temario
- Archivos del llamado de variantes
- VCF
- BCF
- MAF
- Generalidades de la anotación de variantes y herramientas para hacerlo
- Generación de los archivos MAF .
- Diferencias con los VFC
- Pasar de un VCF a un MAF
- Columnas
- Maftools
- MAF summary
- Oncoplot
- Lollipop plot
- Transversiones y transiciones
Nivel
Intermedio
Requisitos
Conocimientos de programación en R
Fecha
30 de agosto
Horario
11-14 hrs (hora CDMX)
FAQ
¿Cuáles son los requisitos para tomar el curso?
Conocimientos de programación en R.Una laptop/computadora Internet Muchas ganas de aprender!!
¿Cuáles son los requisitos computacionales?
Computadora personal con:
- Memoria mínima RAM: 8GB
- Almacenamiento mínimo disponible: 50 GB en disco duro
- Cualquier sistema operativo.
- Tener permisos de administrador para instalar programas.
¿Cómo realizo el pago al curso?
¿Qué pasa después de que me inscribo?
Después de inscribirte deberás enviarnos tu comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com. Posteriormente te haremos llegar tus datos de acceso al curso.
¿Cuánto tiempo tendré acceso al curso?
Tendrás acceso al material del curso y grabaciones para verlo las veces que quieras durante un mes.
¿Qué pasa si no puedo asistir al curso?
Puedes ver la grabación tan pronto esté disponible.
No vivo en México, ¿puedo tomar este curso?
¡Claro que sí! Nuestros cursos online los podrás hacer desde cualquier lugar del mundo, solo necesitas hablar español y ¡listo!
¿Cómo puedo realizar el pago si vivo en el extranjero?
Si vives en el extranjero nosotros te haremos llegar el link de pago mediante de PayPal. La plataforma se encargará de realizar la conversión de tu moneda local a pesos mexicanos de acuerdo al tipo del cambio del día. No es necesario que tengas una cuenta en PayPal.