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Las tecnologías de secuenciación de nueva generación o NGS son herramientas que han revolucionado el campo de la genómica, permitiendo la secuenciación de un gran número de genomas en poco tiempo. Sin embargo, la interpretación de esta información constituye un gran reto desde el punto de vista computacional. En este sentido las NGS, en conjunto con los análisis bioinformáticos, permiten generar los datos de interés del organismo en estudio.

En este curso teórico práctico aprenderás los fundamentos de la bioinformática. Aprenderás a: 

  • Usar la línea de comandos en Linux
  • Mejorar las búsquedas en bases de datos: NCBI, Uniprot, etc.
  • Principios de secuenciación
  • Diseño de proyectos de secuenciación: Ensamblado de genomas, llamado de variantes, etc
  • Realizar el análisis y  control de calidad (FASTQC y Trimming) de muestras
  • Realizar mapeo de lecturas (SAMtools, BWA)
  • Visualización de datos genómicos
  • Más!

No es necesario tener conocimientos previos de programación.

Modalidad: En línea, horario libre
Duración: 20 horas

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Costo promocional: $1,235mxn Válido al 18 de junio

El temario de nuestro curso teórico-práctico es:

INTRODUCCIÓN A LINUX

  • Principios de Linux
  • Sistemas Operativos tipo UNIX
  • Comandos básicos de linux (programación)

BASES DE DATOS

  • Bases de datos primarias: NCBI, Ensembl, UNIPROT
  • Bases de datos especializadas: IMG, PDB

PRINCIPIOS DE SECUENCIACIÓN

  • Tecnologías de secuenciación
  • Principios de secuenciación

ANÁLISIS DE CALIDAD 

  • Archivo FASTQ
  • Control de calidad  y filtrado
  • Parámetros de evaluación
  • Recorte y filtrado
  • FASTQC
  • Trimmomatic
  • Análisis práctico con FASTQC y Trimmomatic

DISEÑO EXPERIMENTAL DE PROYECTOS

  • Ensamblado de genomas
  • Llamado de variantes
  • Microbioma
  • Metagenoma
  • Expresión diferencial con RNA-Seq

MAPEO

  • Mapeo de lecturas
  • BWA
  • Samtools

VISUALIZADORES

  • Visualizadores de datos genómicos
  • IGV

Cada una de las clases consta de un vídeo en el que el profesor explica el contenido del tema asignado. El alumno tiene acceso a estos vídeos a través de la plataforma, donde también dispone de los materiales adicionales.

El horario para visualizar cada uno de los vídeos de las sesiones es completamente libre, de modo que el alumno puede organizar su propio estudio. Las dudas se resuelven a través de correo y foros en la plataforma.

El aprovechamiento de las clases y la participación online se evalúan mediante el control de acceso de la plataforma de cada alumno, el tiempo utilizado y su participación en los foros y actividades.

La evaluación se hará a través de preguntas tipo test que el alumno irá completando a medida que avance el curso. Para obtener el certificado será necesario aprobar cada examen con una calificación mínima de 7 que el alumno encontrará a lo largo del curso.

  • Investigadores 
  • Alumnos de Biología, Medicina, Farmacia, Bioquímica, Biotecnología, Veterinaria, Enfermería, Técnicos de laboratorio y áreas afines.
  • Público en general que quiera conocer principios básicos bioinformática y NGS.

Los estudiantes que aprueben los examenes, obtendrán un Certificado Digital expedido por Winter Genomics.

¿Cuál es la fecha de inicio del curso?

La fecha de inicio es inmediato. Una vez que hayas concluído tu inscripción te enviaremos tus datos de acceso para comenzar a aprender.

¿Cuáles son los requisitos para tomar el curso?

¡Ninguno! No necesitas tener conocimientos previos de bioinformática para tomar el curso. 

¿Mi computadora debe tener Linux para poder tomar el curso?

No. Nosotros recomendamos que tu computadora cumpla las siguientes características:

  • Memoria mínima RAM:  4GB-Windows, 4GB-Mac
  • Almacenamiento mínimo disponible:  20 GB en disco duro
  • Procesador mínimo: Intel Core i3 2.5G hz
  • Sistemas operativos recomendados:

         -Windows 7 o 10
        -Mac OS Sierra, High Sierra, Mojave
        -Ubuntu 14, 16 o 18

En caso de que no sea así, ¡escríbenos con las características de tu computadora y nosotros te asesoramos! 

¿Debo de comprar algún programa o software para tomar el curso?
¡No! Nosotros te haremos llegar todo el material necesario para que puedas tomar el curso sin ningún problema. 
¿Cómo realizo el pago al curso?
Primero debes de registrarte. Al final del formulario encontrarás los datos bancarios. El pago puede ser por depósito o transferencia bancaria.
No vivo en México, ¿puedo tomar este curso?
¡Claro que sí! Nuestros cursos online los podrás hacer desde cualquier lugar del mundo, solo necesitas hablar español y ¡listo! 
¿Cómo puedo realizar el pago si vivo en el extranjero?¿Cuánto me va a costar?

Si vives en el extranjero nosotros te haremos llegar el link de pago mediante de PayPal. La plataforma se encargará de realizar la conversión de tu moneda local a pesos mexicanos de acuerdo al tipo del cambio del día. No es necesario que tengas una cuenta en PayPal.

¿Qué pasa después de que me inscribo?

Después de inscribirte deberás enviarnos tu comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com. Posteriormente te haremos llegar tus datos de acceso al curso.

¿Cuánto tiempo tendré acceso al curso?

Tendrás acceso al curso durante 6 semanas en la plataforma para acceder en el horario que más tú quieras.

¿Cuál es el horario de las clases?
El horario es libre, lo que significa que podrás acceder a la plataforma y tomar las clases en el horario que más te convenga de modo que puedas organizar tu propio estudio. 
¿Qué pasa si tengo dudas durante el programa?
Las dudas se resuelven a través de tutorías y mediante correo electrónico. Nuestra intención es que tengas todo el apoyo para que puedas hacer este curso de manera exitosa.
¿Entregan constancia?

Sí. Los estudiantes que aprueben los examenes y concluyan satisfactoriamente el curso, obtendrán un Certificado. 

COSTO

General: $1,900mxn (90USD)

1) Inscripción

2) Comprobante de pago. Al finalizar la inscripción recibirás los datos para realizar el pago. 

El pago se puede realizar mediante transferencia bancaria o por depósito. 

Si resides en el extranjero, te enviaremos un enlace para realizar el pago en línea. Si resides en Perú, el pago se realiza en USD.

En caso de requerir factura, se deberá incrementar el 16% de IVA al costo del curso.

Es necesario que nos envíes el comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com para poder concluir tu inscripción al curso.

¿TIENES ALGUNA OTRA DUDA?
 ESCRÍBENOS A CURSOS@WINTERGENOMICS.COM