Ensamblado y anotación de genomas bacterianos
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El ensamblado y anotación de genomas bacterianos permite caracterizar microorganismos y su identificación estructural de genes, regiones codificantes y motifs y la funcionalidad de estas regiones.
La caracterización de microorganismos se realiza a través de la identificación de factores de virulencia, análisis comparativos y filogenéticos con otros microorganismos, estudio de redes metabólicas, entre otros.
Nuestro curso de ensamblado y anotación de genomas bacterianos es impartido por expertos en la industria y academia que te guiarán a través de ejemplos prácticos y proyectos.
Aprenderás a programar en Linux y cómo aplicar estas habilidades para analizar datos bioinformáticos y visualizarlos realizando diferentes tipos de gráficos.
Nivel
Principiante
Requisitos
Ninguno
Fecha de inicio
Inmediato
Duración
20 horas, horario libre
Módulo 1 - Programación en Linux
En esta sección aprenderás los conceptos básicos de la programación en Linux y cómo se utilizan en Bioinformática.
Módulo 2 - Procesamiento de datos
En esta sección conocerás los principios de secuenciación masiva. Además, realizarás el control de calidad de datos, eliminación de lecturas de baja calidad mediante línea de comandos.
Módulo 3 - Ensamblado y anotación de genomas
En esta sección, te enseñaremos a realizar el ensamble de datos utilizando k-mer, Abyss, Spades y a evaluar la calidad del Ensamblado de genomas. Realizarás el ordenado de contigs y posteriormente, anota los genomas con Prokka y RAST.
Módulo 4 - Genómica comparativa
Aprenderás a visualizar los datos obtenidos y conocerás el re-arreglo genómico de los datos.
