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La secuenciación masiva es una herramienta importante para la identificación y caracterización de microorganismos. Esta herramienta, en conjunto con los análisis bioinformáticos, permiten generar la secuencia que represente el genoma completo del organismo estudiado, además de la identificación y anotación de sus genes, lo que permite caracterizar metabólicamente el genoma.

¿Qué es el ensamblado y anotación de genomas?

El ensamble permite analizar la información contenida en los genomas, mientras que la anotación del DNA de un genoma consiste en la identificación estructural de genes, regiones codificantes y motifs, así como la identificación funcional de esas regiones.

Posteriormente se caracterizan a los microorganismos a través de la identificación de factores de virulencia, análisis comparativos y filogenéticos con otros microorganismos, estudio de redes metabólicas, entre otros.

El ensamblado y anotación de genomas bacterianos es una herramienta fundamental para todos aquellos que buscan identificar, caracterizar y comprender a su microorganismo estudiado. 

En este curso teórico-práctico aprenderás:

  • Programación en Linux
  • Fundamentos NGS
  • Manejo de FASTQ
  • Análisis de control de calidad  y filtrado (Trimming y QC)
  • Ensamble de datos utilizando k-mer, Abyss, Spades
  • Calidad del Ensamblado
  • Ordenado de contigs
  • Anotación con Prokka y RAST

Modalidad: En línea
Duración: 20 horas

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Personas inscritas hoy

COSTO promocional: $1,800MXN

 

INTRODUCCIÓN A LINUX Y NGS

  • Principios de Linux
  • Sistemas Operativos tipo UNIX
  • Tecnologías NGS
  • Archivo FASTQ
  • Control de calidad  y filtrado
  • Parámetros de evaluación
  • Recorte y filtrado

GENÓMICA COMPARATIVA

  • Visualización
  • Rearreglo genómico

ENSAMBLADO Y ANOTACIÓN

  • Ensamble
  • Determinación parámetro k
  • Ensamble de datos Illumina
  • Evaluación del ensamble
  • Métricas
  • Reordenamiento
  • Anotación

SOFTWARES A USAR

  • FASTQC
  • Trimmomatic
  • Abyss
  • KmerGenie
  • SPADES
  • QUAST
  • MAUVE
  • Prokka
  • RAST

 

Cada una de las clases consta de un vídeo en el que el profesor explica el contenido del tema asignado. El alumno tiene acceso a estos vídeos a través de la plataforma, donde también dispone de los materiales adicionales.

El horario para visualizar cada uno de los vídeos de las sesiones es completamente libre, de modo que el alumno puede organizar su propio estudio. Las dudas se resuelven a través de correo y foros en la plataforma.

  • Investigadores 
  • Alumnos de Biología, Medicina, Farmacia, Bioquímica, Biotecnología, Veterinaria, Enfermería, Técnicos de laboratorio y áreas afines.

Los estudiantes que aprueben los examenes, obtendrán un Certificado Digital expedido por Winter Genomics.

¿Cuál es la fecha de inicio del curso?

La fecha de inicio es inmediato. Una vez que hayas concluído tu inscripción te enviaremos tus datos de acceso para comenzar a aprender.

¿Cuáles son los requisitos para tomar el curso?

¡Ninguno! No necesitas tener conocimientos previos de bioinformática para tomar el curso. 

¿Mi computadora debe tener Linux para poder tomar el curso?

No. Nosotros recomendamos que tu computadora cumpla las siguientes características:

  • Memoria mínima RAM:  4GB-Windows, 4GB-Mac
  • Almacenamiento mínimo disponible:  20 GB en disco duro
  • Procesador mínimo: Intel Core i3 2.5G hz
  • Sistemas operativos recomendados:

         -Windows 7 o 10
        -Mac OS Sierra, High Sierra, Mojave
        -Ubuntu 14, 16 o 18

En caso de que no sea así, ¡escríbenos con las características de tu computadora y nosotros te asesoramos! 

¿Debo de comprar algún programa o software para tomar el curso?
¡No! Nosotros te haremos llegar todo el material necesario para que puedas tomar el curso sin ningún problema. 
¿Cómo realizo el pago al curso?
Primero debes de registrarte. Al final del formulario encontrarás los datos bancarios. El pago puede ser por depósito o transferencia bancaria.
No vivo en México, ¿puedo tomar este curso?
¡Claro que sí! Nuestros cursos online los podrás hacer desde cualquier lugar del mundo, solo necesitas hablar español y ¡listo! 
¿Cómo puedo realizar el pago si vivo en el extranjero?¿Cuánto me va a costar?

Si vives en el extranjero nosotros te haremos llegar el link de pago mediante de PayPal. La plataforma se encargará de realizar la conversión de tu moneda local a pesos mexicanos de acuerdo al tipo del cambio del día. No es necesario que tengas una cuenta en PayPal.

¿Qué pasa después de que me inscribo?

Después de inscribirte deberás enviarnos tu comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com. Posteriormente te haremos llegar tus datos de acceso al curso.

¿Cuánto tiempo tendré acceso al curso?

Tendrás acceso al curso durante 6 semanas en la plataforma para acceder en el horario que más tú quieras.

¿Cuál es el horario de las clases?
El horario es libre, lo que significa que podrás acceder a la plataforma y tomar las clases en el horario que más te convenga de modo que puedas organizar tu propio estudio. 
¿Qué pasa si tengo dudas durante el programa?
Las dudas se resuelven a través de tutorías y mediante correo electrónico. Nuestra intención es que tengas todo el apoyo para que puedas hacer este curso de manera exitosa.
¿Entregan constancia?

Sí. Los estudiantes que aprueben los examenes y concluyan satisfactoriamente el curso, obtendrán un Certificado. 

COSTO

General: $2,350mxn (110 USD)

1) Inscripción

Una vez realizada la inscripción, recibirás los datos bancarios. 

2) Envío de comprobante de pago 

El pago se puede realizar mediante depósito o transferencia bancaria y es necesario que nos envíes el comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com para poder concluir tu inscripción al curso.

Si resides en el extranjero, te enviaremos un enlace para realizar el pago en línea. 
Si resides en Perú, el pago se realiza en USD.

En caso de requerir factura, se deberá incrementar el 16% de IVA al costo del curso.

¿Tienes alguna otra duda?

Escríbenos a cursos@wintergenomics.com