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En este curso teórico-práctico comprenderás la importancia de caracterizar un microbioma y por qué debe estudiarse. Aprenderás a:

  • Programar en R
  • Programar en Linux
  • Principios de secuenciación NGS.
  • Diseñar estudios de microbioma 16S rRNA.
  • Realizar evaluación del control y calidad de las lecturas de secuencias NGS.
  • Análisis e interpretación de datos con dos enfoques QIIME2 y DADA2:
    • Metadatos
    • Quimeras
    • Clustering
  • Realizar análisis de diversidad
    • Bases de datos de 16S
    • Clasificación taxonómica en OTUS
    • Diversidad alfa
    • Índices Shanon, Simpson, etc
    • Rarefacción
    • Gráfica de barras apiladas
    • Diversidad beta
    • PCA

Modalidad: Online

Duración: +20 horas

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Personas inscritas hoy

COSTO PROMOCIONAL: $1,500MXN

Generalidades del microbioma

Microorganismos y taxonomía
  • Orígenes del estudio (historia de microbiología)
  • Efectos dañinos de la presencia de microorganismos (patógenos VS buenos)
  • Importancia de los microorganismos en la biósfera (ciclos biogeoquímicos, etc)
  • Taxonomía
Microbiota, dieta y salud
  • Microbioma
  • Efecto de microbioma en la salud
  • Casos de estudio
Genes 16S ribosomales – relojes moleculares y marcadores taxonómicos
  • Ribosomas
  • Estructura del gen 16S
  • Filogenia con 16S
  • Bases de datos: Green Genes, Silva
  • Bases de datos ITS: Unite
Metagenómica y su impacto 
  • Historia de la Metagenómica
  • Impacto de la Metagenómica
  • Limitantes de análisis de diversidad
Secuenciación Illumina y NGS
  • Tecnología de secuenciación masiva
  • Fundamentos de la tecnología de Illumina
  • Estructura de proyectos NGS

PARTE PRÁCTICA

Introducción a Linux 
  • Comandos básicos
  • Máquina virtual 
Introducción a R
  • Objetos
  • Vectores
  • Dataframes
  • Importar Datos
  • Librerías
Control de Calidad
  • Pre-procesamiento de lecturas
  • Filtros de calidad
QIIME2
  • Determinación de microbioma
  • Características de Qiime
  • Metadatos
  • Quimeras
  • Clustering
DADA2
  • Características de dada2
  • Control de Calidad
  • Metadatos
  • Quimeras
  • Clustering
Análisis de diversidad
  • Bases de datos de 16S
  • Clasificación taxonómica en OTUS
  • Diversidad alfa
  • Índices Shanon, Simpson, etc
  • Rarefacción
  • Gráfica de barras apiladas
  • Diversidad beta
  • PCA

Cada una de las clases consta de un vídeo en el que el profesor explica el contenido del tema asignado. El alumno tiene acceso a estos vídeos a través de la plataforma, donde también dispone de los materiales adicionales.

El horario para visualizar cada uno de los vídeos de las sesiones es completamente libre, de modo que el alumno puede organizar su propio estudio. Las dudas se resuelven a través de correo y foros en la plataforma.

El aprovechamiento de las clases y la participación online se evalúan mediante el control de acceso de la plataforma de cada alumno, el tiempo utilizado y su participación en los foros y actividades.

La evaluación se hará a través de preguntas tipo test que el alumno irá completando a medida que avance el curso. Para obtener el certificado será necesario aprobar cada examen con una calificación mínima de 7 que el alumno encontrará a lo largo del curso.

  • Investigadores 
  • Alumnos de Biología, Medicina, Farmacia, Bioquímica, Biotecnología, Veterinaria, Enfermería, Técnicos de laboratorio y áreas afines.
  • Público en general que quiera conocer principios básicos en microbiota.

Los estudiantes que aprueben los examenes, obtendrán un Certificado Digital expedido por Winter Genomics.

¿Cuál es la fecha de inicio del curso?

La fecha de inicio es inmediato. Una vez que hayas concluído tu inscripción te enviaremos tus datos de acceso para comenzar a aprender.

¿Cuáles son los requisitos para tomar el curso?

¡Ninguno! No necesitas tener conocimientos previos de bioinformática para tomar el curso. 

¿Mi computadora debe tener Linux para poder tomar el curso?

No. Nosotros recomendamos que tu computadora cumpla las siguientes características:

  • Memoria mínima RAM:  4GB-Windows, 4GB-Mac
  • Almacenamiento mínimo disponible:  20 GB en disco duro
  • Procesador mínimo: Intel Core i3 2.5G hz
  • Sistemas operativos recomendados:

         -Windows 7 o 10
        -Mac OS Sierra, High Sierra, Mojave
        -Ubuntu 14, 16 o 18

En caso de que no sea así, ¡escríbenos con las características de tu computadora y nosotros te asesoramos! 

¿Debo de comprar algún programa o software para tomar el curso?
¡No! Nosotros te haremos llegar todo el material necesario para que puedas tomar el curso sin ningún problema. 
¿Cómo realizo el pago al curso?
Primero debes de registrarte. Al final del formulario encontrarás los datos bancarios. El pago puede ser por depósito o transferencia bancaria.
No vivo en México, ¿puedo tomar este curso?
¡Claro que sí! Nuestros cursos online los podrás hacer desde cualquier lugar del mundo, solo necesitas hablar español y ¡listo! 
¿Cómo puedo realizar el pago si vivo en el extranjero?¿Cuánto me va a costar?

Si vives en el extranjero nosotros te haremos llegar el link de pago mediante de PayPal. La plataforma se encargará de realizar la conversión de tu moneda local a pesos mexicanos de acuerdo al tipo del cambio del día. No es necesario que tengas una cuenta en PayPal.

¿Qué pasa después de que me inscribo?

Después de inscribirte deberás enviarnos tu comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com. Posteriormente te haremos llegar tus datos de acceso al curso.

¿Cuánto tiempo tendré acceso al curso?

Tendrás acceso al curso durante 6 semanas en la plataforma para acceder en el horario que más tú quieras.

¿Cuál es el horario de las clases?
El horario es libre, lo que significa que podrás acceder a la plataforma y tomar las clases en el horario que más te convenga de modo que puedas organizar tu propio estudio. 
¿Qué pasa si tengo dudas durante el programa?
Las dudas se resuelven a través de tutorías y mediante correo electrónico. Nuestra intención es que tengas todo el apoyo para que puedas hacer este curso de manera exitosa.
¿Entregan constancia?

Sí. Los estudiantes que aprueben los examenes y concluyan satisfactoriamente el curso, obtendrán un Certificado. 

COSTO PROMOCIONAL $1,900mxn (90USD)

1) Inscripción

2) Envía tu comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com

El pago se puede realizar mediante transferencia bancaria o por depósito. 

Si resides en el extranjero, te enviaremos un enlace para realizar el pago en línea. 

En caso de requerir factura, se deberá incrementar el 16% de IVA al costo del curso.

Si pagas por transferencia o depósito, es necesario que nos envíes el comprobante de pago a cursos@wintergenomics.com para poder concluir tu inscripción al curso.